56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2028 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  45.77 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  45.77 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  47.97 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  45.77 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  45.77 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  45.52 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  43.57 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 		 134 aa  87.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  39.35 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  36.69 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  31.33 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  30.52 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  25.85 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  29.32 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  26.79 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  26.35 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.89 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  28.3 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  21.09 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  25.3 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  27.17 
 
 		 146 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  27.17 
 
 		 146 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  29.13 
 
 		 151 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>