74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1386 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  319  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  55.56 
 
 
139 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  53.62 
 
 
137 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  53.62 
 
 
137 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  53.62 
 
 
137 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  54.07 
 
 
139 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  53.68 
 
 
138 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
166 aa  136  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 
145 aa  131  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  43.7 
 
 
144 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  37.5 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
129 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  35.34 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  34.29 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  28.98 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
283 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  33.81 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  33.55 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  30.65 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  28.14 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
140 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  32.5 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
149 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  45.71 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  22.63 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.52 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.52 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.52 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  28.42 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
141 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  26.4 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  25.29 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
137 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>