113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  100 
 
 
173 aa  337  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
166 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  48.1 
 
 
181 aa  128  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  46.59 
 
 
182 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  45.68 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  45.57 
 
 
164 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  42.66 
 
 
141 aa  91.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  33.12 
 
 
155 aa  91.3  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  32.37 
 
 
183 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  37.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  34.53 
 
 
138 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  37.84 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  33.97 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  34.42 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30.82 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  32.87 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.5 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  32.9 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  28.77 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
132 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  29.45 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.24 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  28.76 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  28.76 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  28.76 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  29.45 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  28.97 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
283 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.46 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
134 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  32.39 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  28.28 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
129 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
141 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.9 
 
 
139 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  27.48 
 
 
134 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  19.46 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  27.11 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
133 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 
154 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.83 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  45.65 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.33 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.65 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.65 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.65 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.65 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>