131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3775 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  81.25 
 
 		 134 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  73.64 
 
 		 135 aa  209  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  72.87 
 
 		 134 aa  207  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  72.09 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  196  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  63.16 
 
 		 138 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  63.28 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  49.59 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  48.28 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  43.9 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  39.2 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  42.4 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  42.4 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  42.4 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  40.8 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  43.09 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  31.85 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.35 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  23.97 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  27.86 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  24.8 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  25.95 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.36 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.59 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  25.24 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>