179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0073 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  279  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 134 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  73.64 
 
 		 134 aa  209  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  67.16 
 
 		 134 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  73.39 
 
 		 132 aa  197  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  193  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 136 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  65.41 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  59.23 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  54.31 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  48.8 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  46.03 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  46.03 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  44.72 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  46.03 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  44.63 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  42.74 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.17 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.78 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  26.61 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  28.32 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0988  thioesterase family protein  26.61 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0576476  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  25.56 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  25.81 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  25 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  25.44 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  24.41 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  24.81 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1045  thioesterase family protein  24.19 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.58 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.62 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.17 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  28.1 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 		 283 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>