43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  269  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  36.15 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  34.85 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  30 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  30.6 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  28.57 
 
 
314 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.14 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  23.66 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.18 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.2 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  27.69 
 
 
136 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
136 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  22.9 
 
 
150 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
148 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  20 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  28.8 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.45 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.83 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2118  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  28.12 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>