55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4436 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
150 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  26.47 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  28.19 
 
 
143 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  26.9 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  28.93 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  28.77 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  30.34 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  27.33 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  22.13 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  28.15 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  24.31 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
133 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.99 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.99 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.99 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  27.27 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.14 
 
 
148 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>