147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3156 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  30.22 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  39.18 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  28.57 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  29.37 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  29.9 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  28.87 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  31.82 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  29.63 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  26.26 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  28.18 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  31.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  31.19 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
148 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
147 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
143 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  28.72 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 
139 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  29.51 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.28 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.25 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.87 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.39 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  32.26 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  32.26 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  29.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  29.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  29.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  29.55 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  31.46 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>