36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02175 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02175  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  331  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
152 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  31.97 
 
 
150 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  31.97 
 
 
150 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  31.97 
 
 
150 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2629  thioesterase-like protein  33.81 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2476  thioesterase-like protein  32.86 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.420578  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  27.13 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
140 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  21.97 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  21.43 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  24 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  23.33 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  23.13 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  22.58 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  18.8 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  25.5 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  25.5 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  25.5 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  22.76 
 
 
158 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  25.33 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  22.86 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  22.22 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>