23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3010 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3010  thioesterase-like protein  100 
 
 		 175 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1854  hypothetical protein  65.62 
 
 		 175 aa  234  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  24.29 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  24.6 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  34.65 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.66 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  22.66 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.22 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  32.67 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 135 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  21.9 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  21.9 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 283 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  22.05 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  21.9 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>