41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0283 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  33.2 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  33.06 
 
 
253 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  33.88 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  35.9 
 
 
245 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  29.63 
 
 
244 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  35.98 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  29.8 
 
 
253 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  25.21 
 
 
249 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  28.44 
 
 
247 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  27.52 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  27.4 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  23.61 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  24.55 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  23.61 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  22.94 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.41 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  28.63 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  24.14 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  25.26 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  23.28 
 
 
318 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  28.46 
 
 
252 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  27.78 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  22.48 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  24.2 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  24.37 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  27.68 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  27.62 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  22.34 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  20.71 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  29.61 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  22.37 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  22.22 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  23.67 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  26.63 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  28.68 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  23.56 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  18.84 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  21.15 
 
 
242 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  21.54 
 
 
300 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>