47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1732 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  50.2 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  45.45 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  34.13 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  35.8 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  35.8 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  35.39 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  34.63 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  30.08 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  27.87 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  31.71 
 
 		 259 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  31.15 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  30.56 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  29.11 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  27.89 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  27.73 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  30.84 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  26.07 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  27.31 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  33.8 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  29.57 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  22.09 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  26.75 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  28.45 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  29.06 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  25.47 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  26.29 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  25.69 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  27.04 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  25.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  23.56 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  24.39 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  22.37 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  23.98 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  21.46 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  23.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  19.56 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  24.47 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 136 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  21 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  29.66 
 
 		 163 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  22.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>