30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 242 aa  508  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.11 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.11 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.11 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  23.3 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  23.04 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  25 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  23.5 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  25.15 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  23.33 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  25.37 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  35.71 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  21.36 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  33.78 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  23.74 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  23.26 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  22.67 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  24.38 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  21.26 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  20.94 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  22.12 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  22.47 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  19.91 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  21.15 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  21.43 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  19.61 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  22.51 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  21.23 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  22.69 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>