41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0335 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 253 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  33.06 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  32.38 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  31.06 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  29.55 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.82 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  24.64 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  23.4 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.48 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  24.75 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.48 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.48 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.67 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  28.12 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  26.5 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  24.77 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  24.76 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  23.26 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  23.98 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  20.64 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  23.68 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  24.8 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  22.33 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  24.15 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  26.47 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  23.94 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  23.32 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  24.51 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  24.9 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  24.15 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  24.2 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  23.2 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  21.03 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  21.05 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  26.98 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  33.78 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  24.24 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  27.94 
 
 		 300 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>