42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1215 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  100 
 
 
247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  52.26 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  47.42 
 
 
242 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  33.2 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  32.79 
 
 
244 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  32.38 
 
 
253 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  31.09 
 
 
249 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  28.16 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  27.67 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  26.46 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  25.78 
 
 
252 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  26.96 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  25.93 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  25.93 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  28.87 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  26.48 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  25.46 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  28.87 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  26.51 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  23.96 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  23.86 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  27.27 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  24.85 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  22.42 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  29.33 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  22.47 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  23.98 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  22.59 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  24.39 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  23.9 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  23.33 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  24.87 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  26.11 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  26.55 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  23.56 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  21.28 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  23.83 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  24.77 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  21.26 
 
 
242 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  28.75 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  25.37 
 
 
142 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>