45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3454 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
248 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  29.6 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  26.34 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  28.64 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  26.19 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  28.36 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.94 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  23.56 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  26.8 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  26.29 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  27.86 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  25 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  28.51 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  24.02 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  24.32 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  22.45 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  25.47 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  23.48 
 
 
300 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  27.96 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  24.43 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  21.43 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  24.4 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  24.14 
 
 
295 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  22.7 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  25.39 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  25.39 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  20.99 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  24.47 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  22.7 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  21.05 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  23.44 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  20.1 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  20.83 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  24.77 
 
 
247 aa  48.5  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  23.11 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  23.56 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.96 
 
 
130 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  20.83 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  21.58 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  20.81 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  28.3 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>