38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1403 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
249 aa  510  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  35.98 
 
 
243 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  29.44 
 
 
244 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  31.06 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  31.09 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  27.78 
 
 
242 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  26.32 
 
 
247 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  31.61 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  27.78 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  27.36 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  26.24 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  28.19 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  24.47 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  25.91 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  24.64 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  26.74 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  23.4 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  25.11 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  25.79 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  22.98 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  22.98 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  25.12 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  27.65 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  27.75 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  22.8 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  26.05 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  22.75 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  25.14 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  27.74 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  21.28 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  22.92 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  29.45 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  29.05 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  23.53 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  24.03 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  19.91 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>