43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2031 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  34.6 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  36.46 
 
 
318 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  31.96 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  28.7 
 
 
243 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  28.34 
 
 
247 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  26.14 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  29.26 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  31.78 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  31.47 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  33.51 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  28.44 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  29.57 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  26.49 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  32.43 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  31.31 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  32.43 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  32.64 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  31.3 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  25.26 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  29.53 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  21.81 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  24.77 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  25 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  25.52 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  25.56 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  23.98 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  28.12 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  25.88 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  24.28 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  24.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  27.03 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  22.67 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  24.64 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  24.62 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  26.67 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  25.56 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  25.56 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  25.56 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  21.79 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  19.83 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  23.72 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>