34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2218 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  631  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  25.49 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  25.26 
 
 		 247 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  24.72 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  24.72 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  25.46 
 
 		 255 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  24.15 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  21.97 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  25.75 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  25.78 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  26.29 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  23.64 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  23.36 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  19.57 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  21.79 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  21.77 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  23.48 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  19.84 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  22.64 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  22.99 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  21.37 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  24.8 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  21.58 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  20.98 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  22.07 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  22.97 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  19.62 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  22.07 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  22.9 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  23.26 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  22.1 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  22.27 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  19.5 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  21.54 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>