270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2914 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  100 
 
 
373 aa  777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  55.76 
 
 
396 aa  434  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  51.08 
 
 
365 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  51.08 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  44.73 
 
 
429 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  45.72 
 
 
381 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.49 
 
 
371 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  46.22 
 
 
382 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  46.68 
 
 
367 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  44.96 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
364 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  44.81 
 
 
364 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  45.48 
 
 
373 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
389 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  40.59 
 
 
368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  39.62 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  37.53 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  38.29 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  49.19 
 
 
194 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
154 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  43.06 
 
 
158 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  29.56 
 
 
367 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
154 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
146 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
188 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  42.27 
 
 
109 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
159 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
168 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.57 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  27.01 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.57 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
171 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2155  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.67 
 
 
154 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0068043  hitchhiker  0.000372679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
156 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
142 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
153 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0227912  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
151 aa  63.2  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  27.34 
 
 
144 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1390  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44 
 
 
147 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.484383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.87 
 
 
148 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4344  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
148 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.333923  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  30.14 
 
 
138 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0659  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.76 
 
 
154 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
153 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
153 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.01 
 
 
158 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.76 
 
 
144 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.11 
 
 
162 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.01 
 
 
158 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.63 
 
 
189 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.01 
 
 
158 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14911  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
153 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.88 
 
 
149 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
294 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
161 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  31.97 
 
 
147 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.94 
 
 
147 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.37 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2145  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.37 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299781  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.19 
 
 
159 aa  53.5  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.25 
 
 
205 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  27.81 
 
 
161 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 
165 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
147 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
142 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.25 
 
 
163 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.75 
 
 
158 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
139 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
150 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.47 
 
 
175 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.28 
 
 
154 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
152 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0171  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
147 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0223271  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.28 
 
 
154 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  31.47 
 
 
148 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
156 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  25.37 
 
 
891 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
155 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  41.79 
 
 
163 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 
148 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.52 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.22 
 
 
163 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>