More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3076 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  57.89 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  47.62 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  48.97 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  43.24 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  45.71 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  42.97 
 
 		 128 aa  94.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  39.02 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  33.56 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  35.26 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  40.17 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  34.84 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  35.03 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  33.77 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  30.72 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  39.8 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.7 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  37.9 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  46.84 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  30.52 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  33.55 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  44.64 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  39.02 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.82 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  37.8 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  34.92 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.38 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.89 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>