More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  71.01 
 
 
172 aa  244  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  71.43 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  69.57 
 
 
173 aa  234  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  71.25 
 
 
166 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  69.7 
 
 
174 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  69.38 
 
 
160 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  69.38 
 
 
160 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  69.38 
 
 
160 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  67.5 
 
 
168 aa  221  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  67.07 
 
 
189 aa  220  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  64.12 
 
 
191 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  65.22 
 
 
196 aa  216  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  69.14 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  67.07 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  67.48 
 
 
170 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  51.66 
 
 
212 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  65.03 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  64.78 
 
 
188 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06840  N-acetylglutamate synthase  57.89 
 
 
176 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  61.25 
 
 
173 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  58.49 
 
 
172 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  59.88 
 
 
171 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  60.38 
 
 
169 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  55.69 
 
 
174 aa  174  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0562  GCN5-related N-acetyltransferase  64.74 
 
 
169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3287  N-acetylglutamate synthase  56.98 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0592405  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  55.21 
 
 
169 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  55.62 
 
 
169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01560  N-acetylglutamate synthase  53.22 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  46.09 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  46.09 
 
 
151 aa  111  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  41.04 
 
 
149 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  44.53 
 
 
149 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  42.97 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
149 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  43.08 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  42.97 
 
 
149 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  45.38 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  40.3 
 
 
150 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  42.31 
 
 
157 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  41.79 
 
 
154 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  41.35 
 
 
155 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 
151 aa  104  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  43.08 
 
 
150 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2898  acetyltransferase  41.54 
 
 
151 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.230698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  38.28 
 
 
159 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.69 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  40.31 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  38.93 
 
 
153 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  39.63 
 
 
626 aa  98.6  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  36.84 
 
 
151 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
182 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  37.59 
 
 
151 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  36.09 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  36.09 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  36.09 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  36.09 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  36.09 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  35.34 
 
 
151 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  35.34 
 
 
151 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0051  N-acetylglutamate synthase  36.72 
 
 
150 aa  91.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  35.29 
 
 
155 aa  91.7  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  37.98 
 
 
162 aa  91.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  35.34 
 
 
151 aa  90.9  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  32.84 
 
 
158 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  39.26 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  38.64 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  32.84 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
645 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4156  N-acetylglutamate synthase  35.34 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  35.16 
 
 
157 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  33.86 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
624 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  31.71 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
624 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  33.58 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  28.23 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  32.31 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2061  acetyltransferase  33.79 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
624 aa  72  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  31.62 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2308  acetyltransferase  33.07 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0452  acetyltransferase  30.4 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  31.39 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  33.01 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 
476 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  36.23 
 
 
438 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  33.58 
 
 
440 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  35.51 
 
 
478 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  32.62 
 
 
441 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  33.58 
 
 
440 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>