50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1238 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1238  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  319  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4020  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.388573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3044  hypothetical protein  30.87 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2804  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120142  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0702  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1773  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.607515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
527 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0714  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  26.81 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.9 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  28.57 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.93 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  24.73 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5353  GCN5-related N-acetyltransferase  24.52 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.884744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  27.59 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.29 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.83 
 
 
179 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2512  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
394 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.76 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4380  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 
430 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.693403  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  24.71 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1545  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  22.67 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  22.44 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.55 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
188 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.18 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716947  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4203  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>