More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2047 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  330  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  97.06 
 
 
178 aa  321  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  87.06 
 
 
171 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  71.05 
 
 
168 aa  187  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  70.32 
 
 
164 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  68.83 
 
 
159 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  42.76 
 
 
364 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
389 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
364 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
154 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
381 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
368 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
382 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  42.76 
 
 
365 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
367 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 
146 aa  97.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  42.76 
 
 
365 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.06 
 
 
158 aa  90.9  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
396 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  42.64 
 
 
381 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
368 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.79 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  34.01 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  37.24 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  34.27 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  45.78 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  31.21 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.5 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.12 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  30.5 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  30.5 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.62 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  35.34 
 
 
141 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.06 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.1 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.24 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.19 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.87 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  29.25 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.59 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.43 
 
 
170 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  50.77 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.51 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.44 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.72 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.97 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.75 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.5 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.72 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.93 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.37 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.97 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.91 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.47 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4703  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.625988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  42.35 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  24.34 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  28.77 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.36 
 
 
148 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.03 
 
 
162 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1458  hypothetical protein  32.61 
 
 
154 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1525  hypothetical protein  32.61 
 
 
154 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  32.85 
 
 
159 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  45.31 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.19 
 
 
152 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.92 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.82 
 
 
145 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
292 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.39 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  29.58 
 
 
148 aa  50.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  40.51 
 
 
891 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.08 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2791  acetyltransferase, GNAT family  35.53 
 
 
282 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139926  hitchhiker  0.000000429249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>