More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2008 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  87.06 
 
 
170 aa  289  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  86.47 
 
 
178 aa  289  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  71.71 
 
 
168 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  70.78 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  69.48 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  43.79 
 
 
364 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
364 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 
368 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
382 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
367 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
154 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 
389 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
188 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
146 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
154 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  42.21 
 
 
365 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  42.21 
 
 
365 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
381 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.13 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
381 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
396 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.71 
 
 
371 aa  80.9  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
368 aa  80.9  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  38.57 
 
 
369 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  35.46 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  31.97 
 
 
373 aa  74.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
364 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
429 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.62 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.04 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  45.35 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.04 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.14 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.76 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.36 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.53 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  32.62 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.48 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  32.62 
 
 
150 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  35.34 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  29.45 
 
 
160 aa  61.2  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
163 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.66 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.87 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.34 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.93 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.55 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.2 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.05 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  49.23 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.56 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3993  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.85 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.5 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.53 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  43.53 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.05 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1890  acetyltransferase  41.54 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1296  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3456  acetyltransferase  41.54 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.436369  hitchhiker  6.246790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1241  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73573  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  41.24 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.26 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.92 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.32 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.83 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.51 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.54 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.75 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
168 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.36 
 
 
149 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
150 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
149 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  25.83 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  23.38 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2791  acetyltransferase, GNAT family  35.53 
 
 
282 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139926  hitchhiker  0.000000429249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1418  putative acetyltransferase  31.47 
 
 
148 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 
205 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2530  acetyltransferase, GNAT family  32.14 
 
 
282 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.82347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>