More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5778 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  353  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2557  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2246  GCN5-related N-acetyltransferase  55.97 
 
 
168 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.886105  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  57.32 
 
 
166 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2884  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
335 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177326  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  32.52 
 
 
416 aa  82  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1185  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0494  acetyltransferase  36.94 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4547  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513868  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03701  acetyltransferase protein  34.76 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.810676 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4084  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.4127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3971  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15635  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5233  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5626  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.895025  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4604  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0639872  hitchhiker  0.000330529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6597  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2657  acetyltransferase  27.71 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.595314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4699  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5452  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2975  acetyltransferase  27.11 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0715346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2680  acetyltransferase  27.11 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000272485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2937  acetyltransferase, GNAT family  27.11 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29735e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  30.43 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  34.59 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2983  acetyltransferase, GNAT family  26.83 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2729  acetyltransferase  26.51 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0707794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2938  acetyltransferase  26.51 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0497  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0061  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.86654  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2943  acetyltransferase, GNAT family  27.44 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0987554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0647  acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0621  acetyltransferase, GNAT family  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1847  acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.541245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0552  acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0494  acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.226849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0496  acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0639  acetyltransferase, GNAT family  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0832714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0583  acetyltransferase  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4718  acetyltransferase, GNAT family  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0709  acetyltransferase, GNAT family  29.27 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2302  acetyltransferase, GNAT family  26.83 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00735826  hitchhiker  0.00000000000000286174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.510558  normal  0.172445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  29.61 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1779  acetyltransferase  32.72 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  28.21 
 
 
2151 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0187  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  32.87 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  32.87 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  32.87 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  32.87 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1088  acetyltransferase  31.47 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  32.87 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  32.87 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2789  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3024  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0893466  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  32.17 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2522  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.25 
 
 
157 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.26 
 
 
155 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28220  acetyltransferase  32.47 
 
 
181 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5667  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
190 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.41 
 
 
183 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.341654 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1641  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
279 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
170 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  22.29 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
368 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  23.5 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.14 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  27.97 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  39.73 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3388  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0979  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0654  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.09 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>