68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28220  acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  50.31 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22184  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0893466  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0035  GCN5-related N-acetyltransferase  36.87 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0309  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22510  predicted acyltransferase  36.42 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2557  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  32.48 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2246  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.886105  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  47.89 
 
 
105 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
176 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  46.15 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  25.33 
 
 
416 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2884  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
335 aa  51.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177326  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14360  acetyltransferase  31.61 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24450  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.33 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5667  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  29.75 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29997  predicted protein  44.44 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.57 
 
 
2151 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3213  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000385875  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
150 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3024  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  47.46 
 
 
591 aa  44.3  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  47.46 
 
 
591 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0654  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  47.46 
 
 
586 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  47.46 
 
 
586 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06700  acetyltransferase  29.75 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0494  acetyltransferase  32.45 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  36.08 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  31.68 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1983  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00080154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5452  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 
168 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
168 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  38.98 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.57 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  37.31 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.35 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0061  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.86654  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
368 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2434  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0979  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>