273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0122 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  95.24 
 
 
147 aa  287  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  63.82 
 
 
173 aa  191  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  65.97 
 
 
149 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  64.58 
 
 
149 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  64.58 
 
 
149 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  60.14 
 
 
146 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  58.33 
 
 
145 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
145 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  58.78 
 
 
144 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  50.35 
 
 
145 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  50.35 
 
 
145 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  50.35 
 
 
145 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  50.35 
 
 
145 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  49.65 
 
 
145 aa  147  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
147 aa  147  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  48.95 
 
 
147 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  48.95 
 
 
147 aa  147  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  48.95 
 
 
147 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  48.95 
 
 
147 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  48.95 
 
 
147 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  48.95 
 
 
147 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  48.92 
 
 
147 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  47.48 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
150 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
150 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  44.68 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  50.34 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  43.17 
 
 
143 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
278 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
147 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  43.97 
 
 
143 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.22282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3024  acetyltransferase  39.6 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
155 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3747  GCN5-related N-acetyltransferase  44.53 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  43.17 
 
 
143 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
146 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
146 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
151 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  39.58 
 
 
162 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4020  acetyltransferase, GNAT family  36.5 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0595  acetyltransferase  34.4 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2721  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2972  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0451042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  36.09 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0469  acetyltransferase  35.66 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0240937  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2287  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4609  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
143 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000167629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1199  acetyltransferase  30.77 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  35.17 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  34.72 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  31.43 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  33.59 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  33.86 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  32.2 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.51 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  28 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  28 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  27.03 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  27.5 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3075  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882795  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  25.83 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  34.15 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  27.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  27.71 
 
 
150 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  27.71 
 
 
150 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>