More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1564 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  38.53 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  47.3 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.77 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.53 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  34.29 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.62 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
143 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
143 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  38.37 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  34.75 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  34.69 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>