More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5172 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 153 aa  186  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.12 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.38 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  27.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  29.2 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  28.18 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  39.74 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.68 
 
 		 312 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.06 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  21.58 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>