More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1265 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  91.78 
 
 		 155 aa  274  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.13 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 327 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  24.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  32.14 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  25.55 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  25.55 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  31.13 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  31.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 324 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.8 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  24.56 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  28.41 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  38.81 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.8 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.8 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.87 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  22.38 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>