More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2533 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 
139 aa  220  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  73.38 
 
 
139 aa  213  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  67.63 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  67.15 
 
 
168 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  67.15 
 
 
154 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  66.42 
 
 
159 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  67.15 
 
 
149 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  66.42 
 
 
159 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  66.42 
 
 
137 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  67.88 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  67.88 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  67.88 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 
138 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 
138 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  50.75 
 
 
138 aa  147  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  52.27 
 
 
135 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  56.49 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
140 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
142 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
137 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
139 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.48 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
172 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
172 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 
220 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
200 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.14 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>