More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0172 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 
153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
352 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
347 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.35 
 
 
349 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
349 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
309 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.79 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
301 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.17 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
322 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
308 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
334 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
307 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
310 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
314 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  31.94 
 
 
312 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
309 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  29.41 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 
309 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  32.65 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.62 
 
 
326 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
175 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
192 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.86 
 
 
308 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
208 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.17 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
312 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.21 
 
 
310 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
201 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  26.83 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
201 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>