More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1543 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  38.81 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  26.87 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  24.8 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25.4 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  36.92 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  30.12 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  31.07 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  29.67 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  47.83 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>