28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1345 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  36.73 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 165 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  29.57 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  36.23 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  21.57 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  23.26 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 336 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 146 aa  40  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>