68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0501 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  280  7.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1883  transcriptional regulator  62.59 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  31.63 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  21.9 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  34.04 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  28.89 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 161 aa  43.5  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 144 aa  42  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  32.88 
 
 		 144 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 316 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  32 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  21.37 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 163 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  29.33 
 
 		 176 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  29.33 
 
 		 176 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  29.33 
 
 		 176 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  29.33 
 
 		 176 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>