More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0544 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  37.33 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  37.68 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  27.93 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  31.82 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  29.67 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  31.15 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.42 
 
 		 316 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  25.24 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>