More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1150 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 165 aa  227  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  70 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  40.54 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  31.45 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  52.08 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0812  transcriptional regulator Hpr  41.43 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.116423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>