293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0295 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
145 aa  287  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
142 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.92 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  28.83 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  27.93 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.17 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  25.22 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  24.74 
 
 
214 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  41.38 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  34.67 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
158 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  27.37 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  27.93 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  25.66 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  31.68 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  25.25 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
152 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
143 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
143 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.68 
 
 
152 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  25.56 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 
146 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  31.08 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>