More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1135 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
154 aa  261  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  57.53 
 
 
157 aa  157  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
144 aa  120  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  45.38 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
156 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
220 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  31.85 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.63 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
168 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
139 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  40 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>