83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1755 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  306  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  26.87 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  32.56 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.18 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 203 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 164 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 137 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 135 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  27.03 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  26.85 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 314 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 158 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>