More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1325 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  310  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  52.03 
 
 
158 aa  124  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
185 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  51.26 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  55.36 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 
187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
158 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
186 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
175 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
204 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  47.06 
 
 
201 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 
203 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 
194 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 
194 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
157 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
164 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.98 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.98 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.3 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  47.71 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.4 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.13 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.25 
 
 
175 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
191 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.78 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
165 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
170 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  28.8 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  38.54 
 
 
261 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  46.27 
 
 
164 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
157 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.26 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
137 aa  51.2  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
132 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>