More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0432 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  80.95 
 
 
170 aa  278  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  67.48 
 
 
185 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  58.08 
 
 
207 aa  194  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 
168 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  55.62 
 
 
165 aa  189  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 
165 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  56.6 
 
 
180 aa  187  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  51.52 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  55.69 
 
 
166 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  51.48 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  50.91 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  52.02 
 
 
170 aa  160  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  49.41 
 
 
177 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  50.88 
 
 
166 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 
168 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  50.93 
 
 
178 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  51.85 
 
 
162 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  48.21 
 
 
173 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  51.23 
 
 
181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  50.61 
 
 
174 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  47.56 
 
 
177 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  34.36 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
138 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
205 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.98 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
143 aa  54.7  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 
144 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.89 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 
170 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.31 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  33.61 
 
 
324 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
166 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
141 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.71 
 
 
162 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
146 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
141 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
145 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
155 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
177 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>