More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0713 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 145 aa  280  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  52.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  58 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  41.11 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  34.82 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  38.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.85 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.03 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>