More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3831 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  36.25 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
170 aa  84  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  37.89 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  30.3 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.4 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40.15 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  32.16 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  31.71 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.91 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  32.97 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  31 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  31 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  27.21 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  31 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  30.36 
 
 
145 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  29.29 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  29.25 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
167 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.63 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  34.78 
 
 
149 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  55.1 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
149 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  37.68 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  43.33 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0640  transcriptional regulator Hpr  27.2 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000651656  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  27.14 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  27.14 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.95 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1457  transcriptional regulator Hpr  27.2 
 
 
205 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.95 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
219 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.95 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>