More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2898 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  46.72 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  45.08 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  42.19 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  37.86 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  39.13 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  38.66 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  38.66 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  39.17 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  38.66 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  38.66 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  38.66 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  37.82 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  38.26 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  37.82 
 
 		 146 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  41.23 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  37.82 
 
 		 146 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  39.47 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  41.23 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  40.35 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  40.35 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.57 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>