More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1558 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  289  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  44.72 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  43.22 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  41.01 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  40.77 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  42.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  42.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  42.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  40.71 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  36.8 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  41.12 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  40.52 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  42.06 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  37.7 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  42.06 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  40.18 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  36.8 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  36.8 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  40.18 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  36.89 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  36.89 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  36.89 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  39.29 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  40.91 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  40.91 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.63 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  33.61 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>