More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1028 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
178 aa  353  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  60.25 
 
 
177 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  54.88 
 
 
173 aa  174  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  56.17 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  57.86 
 
 
168 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  58.75 
 
 
162 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 
174 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  51.88 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  55.9 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  54.66 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  54.66 
 
 
168 aa  160  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  51.88 
 
 
166 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 
179 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  52.05 
 
 
185 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  50.93 
 
 
173 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.91 
 
 
170 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
165 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  45.62 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  50.62 
 
 
165 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  47.31 
 
 
166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.74 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
143 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  40.2 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
139 aa  54.7  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  30.06 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
153 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
150 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
147 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>