267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0472 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  293  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  41.03 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  50.62 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  57.89 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  49.37 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  40.28 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  34.78 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  34.75 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  30.39 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  34.4 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  38.55 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40.58 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  28.7 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>