More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4616 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  346  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.56 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.21 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  31.74 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  32.9 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.16 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  30.13 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  30.63 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  31.14 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.72 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  31.1 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  32.5 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.3 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  26.71 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  31.06 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.03 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  45.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  26.72 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.67 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  26 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  26 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  24.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  26 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  24.66 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>